撰稿:周彦竹 安睿 审校:谭坤
——————————缘起酸菜鱼——————————
前几天小编跟几位好友一同去外边吃酸菜鱼。吃着吃着,小编看着碗里的酸菜,突然好奇心作祟,脑洞大开:有的酸菜质脆爽口、有的酸菜酸味十足,同一个地区的原材料,为什么如此不同?特别酸的酸菜...会不会是因为一些微生物睡醒了让蔬菜发酵用力过猛了呢?
解决好奇心前,我们要先弄清楚:哪些微生物是“醒”着的?为了弄清楚这个问题,小编召集一群朋友查阅资料,结果令小编很失望:目前的方法只能预测样品中微生物的休眠潜力,目前还不能直接有效地监测休眠微生物!!!天啦噜?小编的疑惑岂不是解决不了了!
于是,小编屁颠屁颠的找到我的科学研究学霸好友——陆陆姐姐,寻求这个问题的答案!没想到,陆陆姐姐和她的团队真的解决了小编的困惑!一起看看他们究竟做了什么吧~
—————————不行了~得搬出杀手锏了~——————————
陆陆姐姐的研究提出了一种基于高通量测序技术的休眠微生物鉴定新方法:恢复扩增子序列变异(ASV)监测(RAM)。问题又来了:啥是“高通量测序技术”?
陆陆姐告诉小编:高通量测序技术是能够一次并行对大量核酸分子进行平行序列测定的技术,通常一次测序反应能产出不低于100Mb的测序数据,简单地说就是效率很高的核酸测序技术!!!
她们采用泡菜(中国发酵蔬菜)汤构建封闭实验系统。60天的时间内,她们在26个时间点采集测序样本。利用RAM鉴定样品中的休眠微生物,然后将研究结果与目前使用的基因功能预测(GFP)的结果进行了比较,发现RAM能够识别出更多的休眠微生物!!!
这里小编只能惊呼“高级”!“牛逼”!
——————来看RAM完虐GFP!——————
在60天内,GFP监测了5045个asv270属,RAM监测了27415个asv616属,RAM结果完全包含了GFP。同时,在结果中也发现了GFP和RAM的一致性。两种试验监测的休眠微生物在60天内均表现为四个阶段的分布模式,各阶段间的群落结构存在显著差异。因此,对休眠微生物进行内存监测是有效和可行的!
值得注意的是,GFP和RAM的结果可以相互补充和引用。在未来,从RAM中获得的结果可以作为一个数据库,以扩展和改进GFP对休眠微生物的监测,并且两者可以相互结合,建立一个休眠微生物检测系统。
哇~小编再一次被她们团队的前沿研究所震撼!
陆陆姐姐居然还表示:环境中存在大量的休眠微生物是微生物多样性的重要组成部分,忽视休眠微生物会破坏微生物多样性科学下的所有研究!由此可见,在未来建立一个休眠微生物检测系统是多么重要!
——————重回酸菜鱼——————
回到之前小编的酸菜鱼。通过陆陆姐姐团队的研究,小编请陆陆姐姐帮忙在未来测测酸菜鱼的酸菜里边微生物有多少处于休眠呢~关注小编,不久小编就会告诉大家这个问题的答案哦~
所以~酸菜中的微生物苏醒了,会对人体有什么影响呢?会是大家都能变成“爱因斯坦”?还是仅仅使酸菜变得异常“酸”呢?
小编表示:陆陆姐姐快救救我!